六季了，四只神龟终于上了高中，却发现校长是许瑞德，而同学们全是外星人。
本季开篇，四只神龟因一次空间传送失误，被送入了“正常世界”：纽约市里人类和变种人和平共处，他们被安置在一所普通高中。米开朗基罗爱上了流行音乐，多纳泰罗沉迷物理竞赛，拉斐尔成了橄榄球队长，里昂纳多当了学生会主席。但学校接连发生“优等生失踪”事件。新来的校长——一位温文尔雅的中年慈善家，竟是许瑞德的克隆体，他在用外星科技将优秀学生的大脑改造成“超级大脑军团”，用以征服多元宇宙。神龟们必须在舞会之夜潜入校长办公室，用电磁脉冲中断改造仪。最终，他们选择不回归地下道，而是留在高中保护同学，片尾彩蛋：老师斯普林特成了食堂大厨。
六季以来最大胆的软重启。高中日常与战斗的结合产生了奇妙的化学反应，笑点和泪点并行。许瑞德作为“假好人”的压迫感比以往任何版本都强。这一季是给所有长大了的神龟粉的一封情书。
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